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Omics是一个术语,概述了各种不同的分析,例如基因组学,表观基因组学,转录组学,蛋白质组学,脂质组学和代谢组学。例如,基因组学分析总基因组,转录组学读取总RNA,蛋白质组学评估蛋白质含量。现在,空间组学将分子分析与有关组织内细胞定位的空间信息结合在一起。因此,这项技术为了解重要机制(例如组织组织或细胞调节)提供了强大的工具。
单细胞空间组学
目前正在增强和优化上述方法,尤其是转录组学和蛋白质组学,以实现单细胞分辨率。例如,单细胞空间转录组学是一项非常强大的技术,可根据其在组织中的位置和局部环境,通过每个细胞中的RNA表达水平来了解基因活性。因此,比较转录组学将组织中有关转录活性的不同区域与详细的空间分辨率进行比较。除了单细胞转录组学外,单细胞蛋白质组学领域也正在出现新的和改进的技术,该技术可以检测少量样品中的蛋白质和多肽。由于并非所有的RNA转录物都能翻译成稳定的蛋白质,因此该分析可提供有关细胞活性和状态的进一步见解。
激光显微切割技术是一种利用显微镜技术来识别和选择要分离的目标细胞的技术。在通过精确的激光切割分离不同的组织区域或单个细胞的过程中,组织将保持完整,并且不会解离为悬浮细胞。因此,该方法保持了待分析样品的空间信息,并对其分子含量和活性进行了比较。因此,可以将信息,分子信息和空间信息相关联以获得组织的完整图片。例如,激光显微解剖和空间转录组学可以使整个组织的基因表达水平可视化。
MMI提供MMI CellCut激光显微解剖系统,可将组织精确切割到单个细胞水平。在此处了解有关此技术的更多信息。
在2018年,MMI还开发了用于全玻片成像的MMI CellScan。该工具可扫描整个玻片,并以原始分辨率数字化保存。独一无二的是,MMI CellScan可以在显微镜平台上与激光显微切割有效结合。该功能将大大提高显微切割的工作效率、进一步保护样品活性、获取全视野满分辨率图像、实现远程标记、操控等功能。切割前后的图像可以精确地与切除的组织区域或切除的单个细胞的下游分子分析相关,以进行完整的空间组学分析,例如空间转录组学或空间蛋白质组学。了解有关CellScan及其与MMI CellCut结合的更多信息。
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